合肥工业大学研究生教育始于1960年，1978年恢复招生，1986年开始招收博士研究生，经过多年的积累和发展，逐步形成了层次完整、类型多样的研究生培养体系。

学校现有19个博士学位授权一级学科、3个博士专业学位授权点；39个硕士学位授权一级学科、21个硕士专业学位授予点；学校高质量完成了首轮“双一流”建设任务，顺利进入新一轮“双一流”建设。学校8个学科进入ESI全球排名前百分之一，其中工程科学学科进入ESI全球排名前千分之一。现有（联合）国家重点实验室（培育）和国家工程实验室各1个、教育部重点实验室2个、教育部工程研究中心5个、教育部哲学社会科学实验室（试点）1个、国家国际科技合作基地（示范型）2个，国家地方联合工程研究中心3个、国家地方联合工程实验室1个，安徽省实验室1个。

学校大力实施“人才强校”战略，现有专任教师2300余人，拥有中国工程院院士、中国科学院院士（双聘）、“万人计划”入选者、国家杰出青年科学基金获得者、国家优秀青年科学基金获得者、教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者等各类高层次人才100余人。

学校目前具有硕士、博士研究生13000余人。在研究生教育方面，学校主动适应我国研究生改革与发展的新形势，贯彻“育人为本”的方针，坚持以导师队伍建设为核心，以提高培养质量为关键，通过大力实施“研究生培养质量工程”，不断完善培养体系，规范培养环节，改革培养模式，着力培养研究生的科研创新能力和工程实践能力，保证研究生培养规模与质量的协调发展。